[Botany • 2018] Splitting Echinocactus: Morphological and Molecular Evidence support the Recognition of Homalocephala as A Distinct Genus in the Cacteae ---ScRaBBlE

Figure 1. A Echinocactus platyacanthus from Querétaro B E. horizonthalonius from Chihuahua C Homalocephala texensis from Chihuahua D H. parryi from Chihuahua E H. polycephala subsp. polycephala from Sonora F Kroenleinia grusonii from Querétaro. Line bar in fruit photographs is 1 mm.

in Vargas-Luna, Hernández-Ledesma, Majure, et al., 2018.

 DOI: 10.3897/phytokeys.111.26856

Abstract

Molecular phylogenetic studies of the six currently accepted species in the genus Echinocactus have partially clarified certain aspects of its phylogeny. Most of the studies lack a complete sampling of Echinocactus and are based only in one source of data. Phylogenetic uncertainties in Echinocactus, such as the recognition of Homalocephala as a different genus from Echinocactus, the exclusion of E. grusonii or the affinities of E. polycephalus, are here resolved. Phylogenetic relationships of Echinocactus were reconstructed with a maximum parsimony, a maximum likelihood and a Bayesian approach including 42 morphological characters, four chloroplast markers (atpB-rbcL, trnH-psbA, trnL-trnF and trnK/matK) and two nuclear genes. The utility of these two nuclear regions related to the betalain cycles (DODA and 5GT) are explored and discussed in relation to their potential as phylogenetic markers. Concatenated analyses with morphological and molecular data sets, plus 13 indels (2847 characters and 26 taxa), show general agreement with previous independent phylogenetic proposals but with strong support in order to propose the recognition of a reduced Echinocactus and the recognition of Homalocephala at the generic level. These results recovered a polyphyletic Echinocactus as currently defined. The here-named HEA clade, recovers the species of Homalocephala, Echinocacuts and Astrophytum as a monophyletic group with strong internal support. The Homalocephala (H. texensis, H. parryi and H. polycephala), was recovered as sister to the Echinocactus clade (E. platyacanthus and E. horizonthalonius), plus the Astrophytum clade. Consequently, we propose here to recognise a monophyletic Echinocactus and a monophyletic Homalocephala as two distinct genera with their own molecular and morphological synapomorphies. The evolution of some morphological characters supporting these clades are discussed, the necessary new taxonomic combinations for Homalocephala are proposed and an identification key for the genera, the species and the subspecies of the HEA clade are presented.

Keywords: Cactaceae, HEA clade, morphological character evolution, North American Deserts

Figure 1. A Echinocactus platyacanthus from Querétaro B E. horizonthalonius from Chihuahua C Homalocephala texensis from Chihuahua D H. parryi from Chihuahua E H. polycephala subsp. polycephala from Sonora F Kroenleinia grusonii from Querétaro. Line bar in fruit photographs is 1 mm.

Conclusions: 

This is the first phylogenetic study that has evaluated and combined molecular data from chloroplast and nuclear genomes with morphology to test the monophyly of all species and subspecies of Echinocactus currently accepted. Here we reinforce the proposal of excluding Echinocactus grusonii from the genus. Nevertheless, the recognition of Kroenleinia grusonii must be deeply evaluated since phylogenetic relationships of the Ferocactus clade (including K. grusonii, Leuchtenbergia, Stenocactus, Thelocactus and Glandulicactus) are still unresolved. The well-known HEA clade was recovered as monophyletic with strong support. This clade is morphologically and molecularly well defined, suggesting its taxonomic recognition. Our results also support the proposal that Echinocactus, as currently accepted (excluding K. grusonii), should be considered as two independent lineages, the Homalocephala and the Echinocactus clades, each one with its own molecular and morphological diagnostic characters, and each one representing different genera. In this study, all of the analyses recovered E. polycephalus within the Homalocephala clade, supporting its inclusion in this taxon. Here we present the new taxonomic combinations for the species of Homalocephala and an identification key for the genera of the HEA clade and for all of their species and subspecies.

Homalocephala parryi (Engelm.) Vargas & Bárcenas, comb. nov.

Homalocephala polycephala (Engelm. & J.M. Bigelow) Vargas & Bárcenas, comb. nov.

Homalocephala polycephala subsp. xeranthemoides (J.M. Coult.) Vargas & Bárcenas, comb. nov.

 Mario Daniel Vargas-Luna, Patricia Hernández-Ledesma, Lucas Charles Majure, Raúl Puente-Martínez, Héctor Manuel Hernández Macías and Rolando Tenoch Bárcenas Luna. 2018. Splitting Echinocactus: Morphological and Molecular Evidence support the Recognition of Homalocephala as A Distinct Genus in the Cacteae.  PhytoKeys. 111: 31-59.  DOI: 10.3897/phytokeys.111.26856

---------------------------------------------------------------

روابط التحميل والمشاهدة، الروابط المباشرة للتحميل

من هنا

او

من هنا

شاهد هذا الفيديو القصير لطريقة التحميل البسيطة

منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات

كيف تحصل على مدونة جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات من هنا

شاهد قناة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على اليوتيوب لمزيد من الشرح من هنا

رابط مدونة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات في أي وقت حــــتى لو تم حذفها من هنا
شاهد صفحة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على الفيس بوك لمزيد من الشرح من هنا

تعرف على ترتيب مواضيع منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات (حتى لا تختلط عليك الامور) من هنا

ملاحظة هامة: كل عمليات تنزيل، رفع، وتعديل المواضيع الجاهزة تتم بطريقة آلية، ونعتذر عن اي موضوع مخالف او مخل بالحياء مرفوع بالمدونات الجاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات، ولكم ان تقوموا بحذف هذه المواضيع والمشاركات والطريقة بسيطة وسهلة. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــسلامـ.

[Botany • 2018] Investigating Taxon Boundaries and Extinction Risk in Endemic Chilean Cacti (Copiapoa subsection Cinerei, Cactaceae) Using Chloroplast DNA Sequences, Microsatellite Data and 3D Mapping ---ScRaBBlE

The taxa of Copiapoa subsection Cinerei: A – C Copiapoa gigantea; D C. cinerea subsp. cinerea; E C. cinerea subsp. krainziana; F C. cinerea subsp. columna-alba. 

in Larridon, Veltjen, Semmouri, et al., 2018. 

 DOI: 10.1007/s12225-018-9780-3 

Photos: A, D, E M.-S. Samain; B, C P. C. Guerrero; F I. Larridon.  facebook.com/KewBulletin

Summary

Copiapoa (Cactaceae) is a genus endemic to the Chilean Atacama Desert. The taxa of Copiapoa subsection Cinerei occur in an area of high species richness and high levels of species endemism of the Central Chilean biodiversity hotspot. Four taxa are usually recognised in this group: Copiapoa gigantea (sometimes placed in C. cinerea as C. cinerea subsp. haseltoniana) and C. cinerea including three subspecies (subsp. cinerea, subsp. krainziana and subsp. columna-alba), one of which is often recognised at species level, i.e. the narrow endemic C. krainziana. Here, we evaluate the taxon boundaries of Copiapoa subsection Cinerei using chloroplast sequences and microsatellite data. We generated sequences of three cpDNA markers (rpl32–trnL, trnH–psbA, ycf1) and as indicated in a previous study, found variation between C. gigantea and C. cinerea on a subsample of 34 individuals. Five microsatellite loci were genotyped for 68 individuals from the known range of Copiapoa subsection Cinerei. In contrast with expectations, we found relatively high levels of genetic diversity (e.g., He = 0.775 – 0.827; Ho = 0.580 – 0.750) and no population structure, even between the two species. Additionally, species distribution models were conducted based on abiotic suitability and transformed to 3D maps to account for topographical complexity. The species distribution models and their 3D projections support an allopatric distribution of the four taxa of Copiapoa subsection Cinerei, with each taxon related to a different range with complex topographical features. The obtained molecular results, combined with the presented species distribution modelling, and calculations of extent of occurrence and area of occupancy for the four taxa of Copiapoa subsection Cinerei, suggest a high extinction risk for most of the taxa. A taxonomic treatment is provided.

Key Words: Atacama Desert, conservation, cpDNA, endemic species, population genetics, species distribution modelling 

Fig. 1. The taxa of Copiapoa subsection Cinerei:
A – C Copiapoa gigantea; D C. cinerea subsp. cinerea; E C. cinerea subsp. krainziana; F C. cinerea subsp. columna-alba.

Photos: A, D, E M.-S. Samain; B, C P. C. Guerrero; F I. Larridon.

Isabel Larridon, Emily Veltjen, Ilias Semmouri, Pieter Asselman, Pablo C. Guerrero, Milén Duarte, Helmut E. Walter, Mauricio A. Cisternas and Marie-Stéphanie Samain. 2018. Investigating Taxon Boundaries and Extinction Risk in Endemic Chilean Cacti (Copiapoa subsection Cinerei, Cactaceae) Using Chloroplast DNA Sequences, Microsatellite Data and 3D Mapping. Kew Bulletin. 73:55. DOI: 10.1007/s12225-018-9780-3  

facebook.com/KewBulletin/photos/2308891199344231

---------------------------------------------------------------

روابط التحميل والمشاهدة، الروابط المباشرة للتحميل

من هنا

او

من هنا

شاهد هذا الفيديو القصير لطريقة التحميل البسيطة

منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات

كيف تحصل على مدونة جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات من هنا

شاهد قناة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على اليوتيوب لمزيد من الشرح من هنا

رابط مدونة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات في أي وقت حــــتى لو تم حذفها من هنا
شاهد صفحة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على الفيس بوك لمزيد من الشرح من هنا

تعرف على ترتيب مواضيع منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات (حتى لا تختلط عليك الامور) من هنا

ملاحظة هامة: كل عمليات تنزيل، رفع، وتعديل المواضيع الجاهزة تتم بطريقة آلية، ونعتذر عن اي موضوع مخالف او مخل بالحياء مرفوع بالمدونات الجاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات، ولكم ان تقوموا بحذف هذه المواضيع والمشاركات والطريقة بسيطة وسهلة. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــسلامـ.

[Botany • 2018] Thelocactus tepelmemensis (Cactaceae) • A Distinctive New Species of Thelocactus from Oaxaca, Mexico ---ScRaBBlE

Thelocactus tepelmemensis T.J. Davis, H.M. Hern., G.D. Starr & Gómez-Hin.

in Davis, Hernández, Starr & Gómez-Hinostrosa, 2018.

Tepelmeme Cliff Cactus  ||  DOI: 10.11646/phytotaxa.361.1.10 

Abstract 

Thelocactus tepelmemensis, a distinctive new species of Cactaceae from northern Oaxaca, Mexico, is described and illustrated. The new species is closest to T. leucacanthus but differs significantly from this and other species in the genus by a combination of morphological characters: smaller, red-purple flowers; stems with ribs consistently vertical; lower number of spines per areole, these being usually shorter; ovoid fruit; and seeds with conjunct micropyle. The new species is found in a narrow canyon growing on steep limestone rock faces protected from direct afternoon sun. The only known population appears to be locally common but geographically restricted. 

Keywords: endemic, Oaxaca, Tehuacán-Cuicatlán Biosphere Reserve 

Figure 2. Thelocactus tepelmemensis (body, flower, and fruit) and its habitat.
A. Caespitose individual with several lateral stems (Type). B. Vertical limestone wall with several individuals. C. External aspect of a flower (above); dissected flower showing the internal perianth segments, the stamens, and the gynoecium (middle); and, semi-mature fruit with persistent perianth (below). Voucher: H.M. Hernández et al. 4128 (MEXU).

Figure 1. Thelocactus tepelmemensis. A. Stem with flower. B. Areoles. C. Flower (lateral view and dissected). D. Fruit. Voucher: H.M. Hernández et al. 4128 (MEXU). Drawn by Albino Luna.

Thelocactus tepelmemensis T.J. Davis, H.M. Hern., G.D. Starr, and Gómez-Hin., sp. nov. 

Diagnosis:— Similar to Thelocactus leucacanthus, but differing in having a lower number of spines per areole, these being poorly differentiated into radials and centrals (vs. more and readily differentiated spines); by the much smaller, red-purple flowers (vs. larger yellow or magenta flowers); and, the conjunct seed micropyle lying inside the hilum border (vs. disjunct micropyle lying outside border). 

Type:— MEXICO. Oaxaca, municipality Tepelmeme, 17 January 2018 (fl., fr.), H.M. Hernández et al. 4128 (holotype: MEXU 1471315!; isotypes: DES!, MEXU 1471316!). (Figures 1–3)

....

Etymology:— The specific name refers to the community of Tepelmeme Villa de Morelos in whose territory the new species is currently known. 

The suggested English (Tepelmeme cliff cactus) and Spanish (Biznaga de acantilado de Tepelmeme) names refer to the species’ cliff habitat and the community of Tepelmeme Villa de Morelos.

Tristan J. Davis, Héctor M. Hernández, Greg D. Starr and Carlos Gómez-Hinostrosa. 2018. A Distinctive New Species of Thelocactus (Cactaceae) from Oaxaca, Mexico. Phytotaxa. 361(1);  115–122. DOI: 10.11646/phytotaxa.361.1.10 

Resumen: Se describe e ilustra Thelocactus tepelmemensis, una nueva especie de Cactaceae del norte de Oaxaca, México. La nueva especie está cercanamente relacionada a T. leucacanthus, pero difiere de ésta y otras especies del género por una combinación de caracteres morfológicos, en particular por tener flores más pequeñas, de color rojo-púrpura; los tallos con costillas consistentemente verticales; el número más bajo de espinas por areola, siendo éstas usualmente más cortas; el fruto ovoideo; y las semillas con el micrópilo conjunto. La nueva especie se localiza en un cañón estrecho creciendo sobre paredes verticales de calizas protegidas del sol vespertino. La única población conocida parece ser relativamente densa, pero restringida geográficamente. 

Palabras Clave: endémica, Oaxaca, Reserva de la Biosfera Tehuacán-Cuicatlán

---------------------------------------------------------------

روابط التحميل والمشاهدة، الروابط المباشرة للتحميل

من هنا

او

من هنا

شاهد هذا الفيديو القصير لطريقة التحميل البسيطة

منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات

كيف تحصل على مدونة جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات من هنا

شاهد قناة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على اليوتيوب لمزيد من الشرح من هنا

رابط مدونة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات في أي وقت حــــتى لو تم حذفها من هنا
شاهد صفحة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على الفيس بوك لمزيد من الشرح من هنا

تعرف على ترتيب مواضيع منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات (حتى لا تختلط عليك الامور) من هنا

ملاحظة هامة: كل عمليات تنزيل، رفع، وتعديل المواضيع الجاهزة تتم بطريقة آلية، ونعتذر عن اي موضوع مخالف او مخل بالحياء مرفوع بالمدونات الجاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات، ولكم ان تقوموا بحذف هذه المواضيع والمشاركات والطريقة بسيطة وسهلة. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــسلامـ.