[Ornithology • 2017] Phylogeography of Bulbuls in the Genus Iole (Aves: Pycnonotidae) ---ScRaBBlE

S. Manawatthana, P. Laosinchai, N. Onparn, W.Y. Brockelman & P.D. Round. 2017.
 Phylogeography of Bulbuls in the Genus Iole (Aves: Pycnonotidae). 

Biol. J. Linn. Soc. 120(4); 931-944.  DOI:  10.1093/biolinnean/blw013 

Abstract

Southeast Asia is one of the most geologically dynamic regions of the world with great species diversity and high endemism. We studied the bulbuls of the south and southeast Asian genus Iole (Aves: Pycnonotidae) in order to analyse their evolutionary relationships and describe their patterns of diversification and delimit species boundaries. Our phylogeographic reconstruction, based on two mitochondrial and one nuclear markers, sampled from all 13 recognized Iole taxa, presently grouped as four species, revealing three primary lineages: (1) a Palawan lineage (2) a Sundaic group distributed in the Malay Peninsula, Sumatra and Borneo and (3) an Indochinese group distributed throughout continental Southeast Asia. Divergence time estimation suggested that the Palawan lineage diverged during the Miocene (around 9.7 Mya), a later split between the Sundaic and Indochinese lineages occurring around 7.2 Mya. The present classification of Iole based on morphology does not accurately reflect taxonomic relationships within the genus, in which we recognize five more putative species. An integrative approach that incorporates morphology and bioacoustics should further refine our understanding of species limits among Iole taxa.

Keywords: Iole, phylogeny, phylogeography, pycnonotidae, species tree

Sontaya Manawatthana, Parames Laosinchai, Nuttaphon Onparn,Warren Y. Brockelman and Philip D. Round. 2017. Phylogeography of Bulbuls in the Genus Iole (Aves: Pycnonotidae). Biol. J. Linn. Soc. 120(4); 931-944..  DOI:  10.1093/biolinnean/blw013

facebook.com/photo.php?fbid=1471650692853617

สรุปคร่าวๆเฉพาะส่วนของประเทศไทย 

นกปรอดสกุล Iole (อ่านว่า ไอโอลี่) เดิมพบได้ในไทย 3 ชนิดคือ

1.) นกปรอดเล็กตาขาว (Grey-eyed Bulbul; Iole propinqua)

2.) นกปรอดเล็กสีไพลตาแดง (Olive Bulbul; Iole viridescens)

3.) นกปรอดหงอนตาขาว (Buff-vented Bulbul; Iole charlottae)

ทั้งสามชนิดมีลักษณะภายนอกใกล้เคียงกันมาก 

ซึ่งผลจากการศึกษานี้ทำให้มีนกชนิดใหม่ของไทยเพิ่มขึ้นมาอีก 1 ชนิด คือ

4.) Baker’s Bulbul (Iole cinnamomeoventris; ยังไม่มีชื่อภาษาไทยอย่างเป็นทางการ) 

- นกชนิดใหม่นี้เดิมถูกจัดเป็นเพียงชนิดย่อยของนกปรอดเล็กตาขาว เนื่องจากมีลักษณะภายนอกใกล้เคียงปรอดเล็กตาขาวมากๆ จนหลายๆครั้งในภาคสนามไม่เห็นความแตกต่าง 

- แต่จากการวิเคราะห์ DNA พบว่ามันมีความแตกต่างในเชิงวิวัฒนาการมากจนสมควรจะแยกเป็นชนิดใหม่ และยังพบว่ามีสายวิวัฒนาการใกล้ชิดกับ ปรอดเล็กสีไพลตาแดง (แทนที่จะใกล้ชิดกับปรอดเล็กตาขาวอย่างที่ถูกจัดไว้เป็นชนิดย่อยเดิม) 

- พบในภาคใต้ของไทย บริเวณด้ามขวานตั้งแต่ราวๆ จ.เพชรบุรีลงไปถึงราวๆ จ.สงขลา

- ลักษณะที่ใช้จำแนกในภาคสนามได้ดีที่สุดคือเสียงร้อง จะต่างกับปรอดหงอนตาขาวที่ลักษณะภายนอกคล้ายคลึงกันและพบในบริเวณภาคใต้เหมือนกัน

ตัวอย่างเสียงของ Iole cinnamomeoventris  http://www.xeno-canto.org/336909

ตัวอย่างเสียงของ ปรอดหงอนตาขาว Iole charlottae  http://www.xeno-canto.org/336936

- ชื่อ Baker's Bulbul ตั้งเพื่อเป็นเกียรติแก่ E. C. Stuart Baker นักปักษีวิทยาชาวอังกฤษ ซึ่งเป็นคนแรกที่จำแนกชนิดย่อย cinnamomeoventris นี้ไว้เมื่อปี 1917 

--------------------------------

ถ้านับรวมทั้งเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ เดิมนกปรอดสกุลนี้มีทั้งหมด 4 ชนิด ผล DNA จากการศึกษานี้บ่งชี้ว่าควรจะจำแนกเพิ่มอีก 5 ชนิด รวมเป็น 9 ชนิด ใครสนใจสามารถอ่านรายละเอียดได้ในงานวิจัยฉบับเต็มครับ: academic.oup.com/biolinnean/article-abstract/120/4/931/2970060/Phylogeography-of-bulbuls-in-the-genus-Iole-Aves

ทั้งนี้ เปเปอร์แรกนี้จะเน้นเฉพาะผลจากการวิเคราะห์ DNA อาจจะอ่านยากสำหรับคนทั่วไปซักหน่อย ยังมีเปเปอร์ที่สองที่จะพูดถึงลักษณะภายนอก สีขน และผลการวิเคราะห์เสียงร้อง ที่ตอนนี้กำลังอยู่ระหว่างเตรียมส่งตีพิมพ์ครับ

facebook.com/photo.php?fbid=1471650692853617

---------------------------------------------------------------

روابط التحميل والمشاهدة، الروابط المباشرة للتحميل

من هنا

او

من هنا

شاهد هذا الفيديو القصير لطريقة التحميل البسيطة

منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات

كيف تحصل على مدونة جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات من هنا

شاهد قناة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على اليوتيوب لمزيد من الشرح من هنا

رابط مدونة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات في أي وقت حــــتى لو تم حذفها من هنا
شاهد صفحة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على الفيس بوك لمزيد من الشرح من هنا

تعرف على ترتيب مواضيع منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات (حتى لا تختلط عليك الامور) من هنا

ملاحظة هامة: كل عمليات تنزيل، رفع، وتعديل المواضيع الجاهزة تتم بطريقة آلية، ونعتذر عن اي موضوع مخالف او مخل بالحياء مرفوع بالمدونات الجاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات، ولكم ان تقوموا بحذف هذه المواضيع والمشاركات والطريقة بسيطة وسهلة. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــسلامـ.

[Herpetology • 2019] Endemic, Endangered and Evolutionarily Significant: Cryptic Lineages in Seychelles' Frogs (Anura: Sooglossidae) ---ScRaBBlE

Family Sooglossidae 

Sechellophryne spp. 

Sooglossus spp. 

in Labisko, Griffiths, Chong-Seng, et al., 2019. 

  DOI:  10.1093/biolinnean/bly183  

 twitter.com/JimLabisko

Abstract

Cryptic diversity corresponding with island of origin has been previously reported in the endemic, geographically restricted sooglossid frogs of the Seychelles archipelago. The evolutionary pattern behind this has not been fully explored, and given current amphibian declines and the increased extinction risk faced by island species, we sought to identify evolutionarily significant units (ESUs) to address conservation concerns for these highly threatened anurans. We obtained genetic data for two mitochondrial (mtDNA) and four nuclear (nuDNA) genes from all known populations of sooglossid frog (on the islands of Mahé, Praslin and Silhouette) for phylogenetic analyses and to construct nuDNA haplotype networks. Bayesian and maximum likelihood analyses of mtDNA support the monophyly and molecular differentiation of populations in all species that occur on multiple islands. Haplotype networks using statistical parsimony revealed multiple high-frequency haplotypes shared between islands and taxa, in addition to numerous geographically distinct (island-specific) haplotypes for each species. We consider each island-specific population of sooglossid frog as an ESU and advise conservation managers to do likewise. Furthermore, our results identify each island lineage as a candidate species, evidence for which is supported by analyses of mtDNA based on Bayesian Poisson tree processes, and independent analyses of mtDNA and nuDNA using the multispecies coalescent. Our findings add to the growing understanding of the biogeography and hidden diversity within this globally important region.

Keywords: candidate species, cryptic diversity, evolutionarily significant unit, Indian Ocean, insular amphibians, islands, Sechellophryne, Seychelles, Sooglossidae, Sooglossus

Jim Labisko, Richard A. Griffiths, Lindsay Chong-Seng, Nancy Bunbury, Simon T. Maddock, Kay S. Bradfield, Michelle L. Taylor and Jim J Groombridge. 2019. Endemic, Endangered and Evolutionarily Significant: Cryptic Lineages in Seychelles' Frogs (Anura: Sooglossidae).  Biological Journal of the Linnean Society. bly183 DOI:  10.1093/biolinnean/bly183 

 twitter.com/JimLabisko/status/1086639417349963776

@SeyAmphibians @Simon_Maddock @BiolJLinnSoc

    

---------------------------------------------------------------

روابط التحميل والمشاهدة، الروابط المباشرة للتحميل

من هنا

او

من هنا

شاهد هذا الفيديو القصير لطريقة التحميل البسيطة

منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات

كيف تحصل على مدونة جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات من هنا

شاهد قناة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على اليوتيوب لمزيد من الشرح من هنا

رابط مدونة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات في أي وقت حــــتى لو تم حذفها من هنا
شاهد صفحة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على الفيس بوك لمزيد من الشرح من هنا

تعرف على ترتيب مواضيع منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات (حتى لا تختلط عليك الامور) من هنا

ملاحظة هامة: كل عمليات تنزيل، رفع، وتعديل المواضيع الجاهزة تتم بطريقة آلية، ونعتذر عن اي موضوع مخالف او مخل بالحياء مرفوع بالمدونات الجاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات، ولكم ان تقوموا بحذف هذه المواضيع والمشاركات والطريقة بسيطة وسهلة. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــسلامـ.

[Herpetology • 2018] Phylogenomics of Montane Frogs of the Brazilian Atlantic Forest is Consistent with Isolation in Sky Islands Followed by Climatic Stability ---ScRaBBlE

Brachycephalus investigated in the present study. 
 Brachycephalus brunneus; B. izecksohni; B. fuscolineatus & B. auroguttatus. 

in Pie, Faircloth, Ribeiro, et al., 2018.

DOI: 10.1093/biolinnean/bly093  

 twitter.com/MarcioPie

Abstract

Despite encompassing a relatively small geographical area, montane regions harbour disproportionately high levels of species diversity and endemism. Nonetheless, relatively little is known about the evolutionary mechanisms that ultimately lead to montane diversity. In this study, we used target capture of ultraconserved elements to investigate the phylogenetic relationships and diversification patterns of Melanophryniscus (Bufonidae) and Brachycephalus (Brachycephalidae), two frog genera that occur in sky islands of the southern Atlantic Forest of Brazil. Specifically, we tested whether diversification of montane species in these genera could be explained by a single climatic shift leading to isolation in sky islands, followed by climatic stability that maintained populations in allopatry. In both genera, the topologies inferred using concatenation and coalescent-based methods were concordant and had strong nodal support, except for a few recent splits, which nevertheless tended to be supported by more informative loci. Estimation of divergence time of a combined dataset using both genera is consistent with a concordant timing of their diversification. These results support the scenario of diversification by isolation in sky islands and suggest that allopatry attributable to climatic gradients in montane regions is an important mechanism for generating species diversity and endemism in these regions.

Brachycephalus, coalescent, Melanophryniscus, target enrichment, ultraconserved elements

Figure 1. Examples of the species of Brachycephalus investigated in the present study.
E, Brachycephalus brunneus. F, Brachycephalus izecksohni. G, Brachycephalus fuscolineatus. H, Brachycephalus auroguttatus.

Photographs by L.F. Ribeiro.

 twitter.com/MarcioPie

Marcio R. Pie, Brant C. Faircloth, Luiz F. Ribeiro, Marcos R. Bornschein and John E Mccormack. 2018. Phylogenomics of Montane Frogs of the Brazilian Atlantic Forest is Consistent with Isolation in Sky Islands Followed by Climatic Stability. Biological Journal of the Linnean Society. bly093.   DOI: 10.1093/biolinnean/bly093   

twitter.com/MarcioPie/status/1018966075323666432

Marcio R. Pie, Brant C Faircloth, Luiz Fernando Ribeiro, Marcos R. Bornschein and John McCormack. 2018. Phylogenomics of montane frogs of the Brazilian Atlantic Forest supports a scenario of isolation in sky islands followed by relative climatic stability. bioRxiv. 226159.  DOI: 10.1101/226159

---------------------------------------------------------------

روابط التحميل والمشاهدة، الروابط المباشرة للتحميل

من هنا

او

من هنا

شاهد هذا الفيديو القصير لطريقة التحميل البسيطة

منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات

كيف تحصل على مدونة جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات من هنا

شاهد قناة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على اليوتيوب لمزيد من الشرح من هنا

رابط مدونة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات في أي وقت حــــتى لو تم حذفها من هنا
شاهد صفحة منتدى مدونات بلوجر جاهزة بألاف المواضيع والمشاركات على الفيس بوك لمزيد من الشرح من هنا

تعرف على ترتيب مواضيع منتدى مدونات بلوجر جاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات (حتى لا تختلط عليك الامور) من هنا

ملاحظة هامة: كل عمليات تنزيل، رفع، وتعديل المواضيع الجاهزة تتم بطريقة آلية، ونعتذر عن اي موضوع مخالف او مخل بالحياء مرفوع بالمدونات الجاهزة بآلاف المواضيع والمشاركات، ولكم ان تقوموا بحذف هذه المواضيع والمشاركات والطريقة بسيطة وسهلة. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــسلامـ.